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Aug 31, 2023Aug 31, 2023

Nature Communications volume 14, número do artigo: 3692 (2023) Citar este artigo

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A vigilância em tempo real do vírus SARS-CoV-2 transmitido pelo ar é uma lacuna tecnológica que tem escapado à comunidade científica desde o início da pandemia da COVID-19. As técnicas de amostragem de ar off-line para detecção de SARS-CoV-2 apresentam tempos de resposta mais longos e exigem mão de obra qualificada. Aqui, apresentamos um monitor de qualidade do ar patogênico (pAQ) de prova de conceito para detecção direta em tempo real (resolução de 5 minutos) de aerossóis SARS-CoV-2. O sistema integra sinergicamente um amostrador de ar de ciclone úmido de alto fluxo (~1000 lpm) e um biossensor de microimunoeletrodo ultrassensível baseado em nanocorpos. O ciclone úmido apresentou desempenho de amostragem de vírus comparável ou melhor do que os amostradores disponíveis comercialmente. Experimentos de laboratório demonstram uma sensibilidade do dispositivo de 77 a 83% e um limite de detecção de 7 a 35 cópias de RNA viral/m3 de ar. Nosso monitor pAQ é adequado para vigilância pontual de variantes do SARS-CoV-2 em ambientes internos e pode ser adaptado para detecção multiplexada de outros patógenos respiratórios de interesse. A adopção generalizada de tal tecnologia poderia ajudar as autoridades de saúde pública na implementação de medidas rápidas de controlo de doenças.

A pandemia da doença coronavírus 2019 (COVID-19), que começou em dezembro de 2019, ainda assola países em todo o mundo, com a Organização Mundial da Saúde relatando mais de 1,7 milhão de novos casos confirmados em todo o mundo durante a primeira semana de janeiro de 20231. O coronavírus 2 da síndrome respiratória aguda grave (SARS) -CoV-2) causa esta doença e se espalha através de gotículas respiratórias expelidas de pessoas infectadas durante a tosse, espirro, respiração e fala. A transmissão aérea é reconhecida como uma das vias de infecção predominantes2,3, daí a rápida taxa de infectividade e a natureza virulenta da doença. Para combater esta rápida propagação, governos de todo o mundo adoptaram políticas como a obrigatoriedade de máscara em espaços públicos, a quarentena de indivíduos infectados e o distanciamento social para ajudar a reduzir o risco de transmissão aérea. No entanto, tais medidas de controlo tiveram um impacto negativo na vida quotidiana, com consequências como restrições às viagens aéreas, diminuição das actividades físicas, restrições a grandes reuniões sociais e encerramento de escolas e escritórios. Muitos países demoraram quase 2 anos para retomar as atividades normais. No entanto, o medo da infecção e o rápido ressurgimento periódico da doença, por exemplo, no final de Dezembro de 2022 na China4, realçam o despreparo mesmo das maiores nações no combate à propagação de agentes patogénicos no ar. A indisponibilidade de protocolos de detecção de infecção rápidos e acessíveis a nível comunitário tem sido um factor limitante para os decisores políticos na implementação de estratégias imediatas de mitigação da transmissão da COVID-19. Um dispositivo de vigilância não invasivo em tempo real que possa detectar aerossóis SARS-CoV-2 diretamente no ar é uma solução potencial para estratégias de gerenciamento de infecções e a retomada das atividades normais.

Técnicas de amostragem de ar off-line são comumente usadas para detecção de aerossóis de vírus, onde a coleta e análise de amostras são feitas em dois estágios: primeiro, os aerossóis de vírus são coletados usando amostradores de bioaerossóis independentes, após o que as amostras são transportadas para um laboratório para análise posterior. Estudos recentes usaram técnicas de amostragem de ar off-line, como amostradores de partículas baseadas em crescimento de condensação em amostradores de líquido (PILS), PILS baseados em ciclones de parede úmida e amostragem de filtro, seguida de detecção de vírus usando reação em cadeia da polimerase quantitativa por transcrição reversa (RT-qPCR) detectar a presença do RNA do SARS-CoV-2 no ar dentro de hospitais5,6,7,8,9, shopping centers10, transporte público10, quartos residenciais11 e até mesmo no ar externo12,13. Embora estas descobertas ressaltem a importância de um método de vigilância para detectar vírus transmitidos pelo ar para controlar a propagação da infecção, estes métodos off-line têm um longo tempo de resposta (1-24 horas), requerem mão de obra qualificada e não fornecem informações em tempo real, o que é necessário tomar medidas de controlo rápidas para gerir a propagação do vírus no ar.

95% collection efficiency for particles >1 μm and a cutoff diameter (where the collection efficiency is 50%) of 0.4 μm./p>10,000 copies/m3 (“high”). All experiments were performed either in duplicate or triplicate runs. A detailed description of the experimental setup and protocol is provided in Supplementary Method 5./p>200 lpm) had the highest virus recovery and were ideal for virus detection in an environment with low virus concentrations. However, low flowrate samplers (e.g., BioSampler®) provide a more accurate estimate of the virus concentration in the air. A similar finding was also reported by Luhung et al.40, where they investigated the effect of increasing the bioaerosol sampler flow rate (100 lpm to 300 lpm) on the bioaerosol recovery and concluded that high-flow air sampling maximized the time resolution and improved virus capture rate, especially at ultra-low bioaerosol concentrations. However, high-flow sampling is susceptible to inaccurate estimation of bioaerosol concentration per unit air volume. The underestimation of the virus RNA concentration by the wet cyclone in the chamber study could be due to evaporative losses, particle loss to the chamber walls, re-entrainment loss, or particle bounce commonly observed in high-flow wet cyclone sampling41,42./p>10,000 copies/m3 (high; n = 4). The data are presented as mean ± 1 SD of ‘n’ independent experiments (b) typical concentration of SARS-CoV-2 RNA copies measured in indoor air; the vertical dotted lines demarcate the low, medium and high virus concentration test levels; c PCR Ct value (inverted y-axis) of indoor air samples collected using the wet cyclone in apartments with SARS-CoV-2-positive patients (n = 7) and control room (n = 3). The data are presented as mean ± 1 SD of ‘n’ independent samples./p>1 μm ( ~ 100% collection efficiency). The LoD for the virus in the submicron-sized aerosols will vary based on the wet cyclone particle size-dependent recovery fraction (Supplementary Fig. 2). Fig. 3b shows the pAQ monitor performance when sampling laboratory aerosolized inactivated WA-1 and BA-1. pAQ monitor showed a sensitivity of 77% for WA-1 and 83.3% for BA-1. The concentrations of WA-1 aerosol samples measured using RT-qPCR are provided in Supplementary Fig. 7. The virus sensitivity of the pAQ is comparable to the sensitivity of other recently developed rapid biosensors (<10 min detection time) used for detecting viruses in saliva43,44, nasal swabs45, and exhaled breath condensate25 samples./p>